ADMIXTURE 安装指南

https://dalexander.github.io/admixture/binaries/admixture_linux-1.3.0.tar.gz

1. 创建工具目录并进入

首先，创建一个 tools 目录用于存放所有的工具，并进入该目录：

mkdir -p ~/tools ; cd ~/tools

2. 下载 ADMIXTURE 安装包

使用 wget 下载 admixture 安装包：

wget https://dalexander.github.io/admixture/binaries/admixture_linux-1.3.0.tar.gz

3. 解压安装包

解压下载的 tar.gz 文件：

tar -zxvf admixture_linux-1.3.0.tar.gz

4. 临时设置环境变量

假设你将 admixture 解压到 ~/tools/admixture_linux-1.3.0 目录下，接下来需要设置环境变量，方便在命令行中直接运行 admixture。

• 打开并编辑你的 shell 配置文件（如 .bashrc 或 .zshrc，具体取决于你使用的 shell），并添加以下两行：

  export ADMIXTURE=~/tools/admixture_linux-1.3.0
  export PATH=$ADMIXTURE:$PATH

永久加入环境变量

将上述两行添加到你的 shell 配置文件中（如 ~/.bashrc 或 ~/.zshrc），以便每次打开终端时自动加载：

echo "export ADMIXTURE=~/tools/admixture_linux-1.3.0" >> ~/.bashrc
echo "export PATH=\$ADMIXTURE:\$PATH" >> ~/.bashrc

5. 更新环境变量

使环境变量配置生效：

source ~/.bashrc  
# 或者重新登录下

6. 验证安装

通过运行 admixture 命令来验证安装是否成功：

admixture --help

如果看到帮助信息，说明 ADMIXTURE 已成功安装并配置。