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安装我们准备好的 QIIME2 环境(推荐)
以下步骤演示如何使用我们预先打包好的 QIIME2 CondaPack 环境,无需在线创建环境,可直接解压即可使用。
1. 下载打包好的 QIIME2 环境
bash
wget http://192.168.5.250:8011/softs/condaPacks/qiime2-amplicon-2024.10.tar.gz2. 创建空环境并获取 Conda 安装目录
bash
conda create -n qiime2 -y
CONDA_BASE="$(conda info --base)"3. 解压 CondaPack
bash
mkdir qiime2
tar -xzf qiime2-amplicon-2024.10.tar.gz -C qiime24. 替换原来的环境目录
将 Conda 自动创建的空环境备份:
bash
mv "$CONDA_BASE/envs/qiime2" "$CONDA_BASE/envs/qiime2.bak"将解压得到的环境移动进去:
bash
mv qiime2 "$CONDA_BASE/envs/qiime2"5. 激活环境
bash
conda activate qiime2
conda-unpackconda-unpack 会修复 CondaPack 环境中原机器的路径,首次解压后必须执行一次。
6. 测试 QIIME2 是否可用
bash
qiime --version示例输出:
q2cli version 2024.10.1
Run `qiime info` for more version details.